作为数据分析语言三剑客之一的Julia，一直以来在生物学领域并没有得到太多的重视。但在数学、物理、化学以及工程计算领域，Julia语言的应用范围一直在不断拓展。2023年Elisabeth Roesch等人在文章Julia for Biologists中为生物学家使用Julia的方方面做了一个较为详尽的概述，从一个宏观的角度推动生物计算开发者尝试这门拥有多种特性的编程语言。 ASCT: Automatic Single-Cell Toolbox 基于对Julia语言的开发兴趣，以及想要建立一个尽量为用户提供自动化参数选择，同时保持灵活性的单细胞数据下游分析工具，西湖大学高性能计算中心开源了一个100%由Julia编写的工具ASCT。该工具目前在github上发布了完全开源的0.9.0版本，并提供了基本分析流程和使用Harmony算法实现的数据整合流程。该工具基本对标R上的Seurat v4版本，并能对不同来源的数据进行一些自适应的参数设置而无需用户自行摸索。本文以其提供的pbmc3k流程来大致介绍该工具的基本使用方法。...
