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Articles by Benoît Roux
Structural basis of voltage gating in a partially activated K + channel
Abstract To understand the process of voltage activation in Kv channels, we determined the cryo-EM structure of the Shaker channel ILT mutant (V369I, I372L, S376T), known to partially decouple the gating charge movement of the voltage sensing domain (VSD) and the opening of the pore domain (PD). The structure captures an intermediate state in which the VSD is only partially activated while the gate of the PD remains closed.
Incendie en série dans les Pyrénées : déjà des centaines d’hectares brûlés avant l'arrivée d'un nouveau pic de chaleur
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Convergence is not correctness: context-dependent performance of enhanced-sampling methods across biological complexity
Abstract Enhanced-sampling molecular dynamics is indispensable for studying biomolecular processes beyond the reach of conventional simulation, yet its reliability in realistic biological settings remains poorly characterized.
Mort de Lyhanna : le tribunal d'Auch refuse d'être le bouc émissaire et dénonce une "vindicte populaire encouragée par un discours politique décomplexé"
Patrick Bruel 1 hour ago Affaire Patrick Bruel : le parquet requiert la mise en examen et l'incarcération du chanteur France 24 - FRANCE 24 • 1h Le parquet de Nanterre a requis l'ouverture d'une information judiciaire et la mise en examen de Patrick Bruel pour des faits de viols, tentatives de viols, agressions sexuelles et harcèlement sexuel concernant neuf victimes, commis entre 2010 et 2019, selon un communiqué publié ce mercredi … Patrick Bruel 1 hour ago Affaire Patrick Bruel : le...
GPU-Accelerated Implementation of Constant-pH Molecular Dynamics in NAMD
Cite Jump to ExpandCollapse Computational BiochemistryDecember 9, 2025 GPU-Accelerated Implementation of Constant-pH Molecular Dynamics in NAMD Click to copy article linkArticle link copied! Sarah Moe Sarah Moe Department of Chemistry, The University of Chicago, Chicago, Illinois 60637, United States Christophe Chipot Christophe Chipot Laboratoire International Associé Centre National de la Recherche Scientifique et University of Illinois at Urbana−Champaign, Unité Mixte de Recherche No....
The Dawn of Alchemical Free-Energy Methods in Biomolecular Simulations
Cite Jump to ExpandCollapse Featured ArticleNovember 21, 2025 The Dawn of Alchemical Free-Energy Methods in Biomolecular Simulations Click to copy article linkArticle link copied! Daniele Macuglia Daniele Macuglia Department of History of Science, Technology and Medicine, Academy for Advanced Interdisciplinary Studies, Peking University, Beijing 100871, China Giovanni Ciccotti Giovanni Ciccotti Department of Physics, University of Rome “La Sapienza”, Rome 00185, Italy IAC--CNR, Institute for...
Kinetic Modeling of Covalent Inhibition: Effects of Rapidly Fluctuating Intermediate States
Abstract There is increasing interest in the discovery of small-molecule inhibitors that form covalent bonds with their targets for therapeutic applications. Nevertheless, identifying clear rational design principles remains challenging because the action of these molecules cannot be understood as common noncovalent inhibitors.
TÉMOIGNAGES. "J'ai eu très peur" : des avocats marqués par l'agression d’une rare violence en salle d’audience du Palais de justice
Now De nombreux soldats ukrainiens sont en captivité en Russie depuis plus de trois ans, où ils sont souvent torturés, maltraités et où l'on tente de les retourner idéologiquement, en leur proposant de "rejoindre les forces russes pour marcher ensemble sur l'Europe". La parole d'un revenant. Lorsque …
"Nous ne jouerons pas nues" : après la surexposition de JO Paris 2024, les deux championnes de beach-volley sans sponsors sont "à poil"
Now Le Cochon à l’Oreille, institution du quartier des Halles, en danger de disparition Il est de ces lieux qu’on croit inamovibles, posés là pour l’éternité, à servir des plats mitonnés avec amour dans un décor de carte postale. Il est … 2 hours ago Dans ce restaurant à Boulogne, la gastronomie se réinvente avec créativité Dans un petit écrin intimiste à Boulogne, le chef Rémi Braflan, signe une cuisine aussi inventive que minutieuse, où chaque assiette colorée met à …
Commémorations 8 mai. "Sauver 500 enfants juif c’était leur devoir". Le fils de Bouli et Shatta Simon raconte
Grâce à la détermination exceptionnelle de Shatta et Bouli Simon, 500 enfants venus de tous les coins d’Europe ont échappé à la barbarie nazie. Leur fils Jean-Claude participait aux commémorations du 8 mai 1945. L'occasion de perpétuer l'acte héroïque de ses parents. Ils s’appellent Sarolta Hirsch et Edouard Simon. Ils ont à peine trente ans. Durant la seconde guerre mondiale, ils ont sauvé 500 enfants juifs dans une maison à Moissac située au 18 quai du port.
Une rave-party réunissant plusieurs milliers de personnes interdite par la préfecture
Un rassemblement type "Rave Party" a pris place sur le secteur de Rocamadour/Montvalent (Lot) dans la nuit du 7 au 8 mai. La préfecture tenait un point presse ce jeudi pour resignifier son interdiction. Les accès sont bloqués et des contrôles sont en place. Les RD 840 et RD 70 sont fermées à la circulation. 6 000 personnes selon la préfecture du Lot se sont donné rendez-vous pour ce pont du 8 mai 2025 sur l'ancienne base militaire de Viroulou située sur le secteur de Rocamadour/Montvalent.
"Ils vont pouvoir s’entraîner sur un très beau sol où l’équipe de France a gagné des titres" : les frères Karabatic très fiers de leur financement
3 communes de Haute-Garonne viennent de faire l’acquisition de sols qui ont vu évoluer l'équipe de France de Handball. Après Tournefeuille, voici Castanet Tolosan et Ramonville. Collectivités, donateurs et même les frères Karabatic on mit la main à la poche pour combiner promotion du sport, économie et écologie. Recycler les infrastructures sportives ayant servi pour des événements mondiaux comme les JO c'est désormais une habitude.
Dramatique accident train voiture : un joueur du Castres Olympique trouve la mort
Ce matin 8 mai 2025, un accident de la circulation a eu lieu sur un passage à niveau sur la commune de Saïx (Tarn). Un TER avec 21 passagers a percuté une voiture. Le conducteur était Josaia Raisuqe un joueur du Castres Olympique. Il n'a pas survécu au choc. Un dramatique accident est survenu ce matin vers 8h sur la commune de Saïx près de Castres dans le Tarn. Un train TER faisant la liaison Toulouse-Mazamet a percuté un véhicule au passage à niveau de la commune de Saïx.
"Un instrument qui donne le meilleur de la science" : Mercator devient, enfin, le fer de lance européen de la surveillance numérique des océans
C'est la vigie des océans. Mercator Océan vient d'élaborer une réplique numérique des océans, histoire de mieux les connaître pour mieux appréhender l'impact du changement climatique. Une initiative de l'Union Européenne réalisée depuis Toulouse (Haute-Garonne) et accessible à tous. Pierre Bahurel le Directeur Général de l'entreprise toulousaine nous explique. Ils recouvrent plus de 70 % de notre planète : les océans subissent eux aussi les changements climatiques.
"Ils veulent nous mettre au travail tout de suite" : les salariés de Safra choisissent le groupe TTH pour sauver leur entreprise, fleuron du bus à hydrogène
Les 169 salariés se sont prononcés le lundi 28 avril 2025 en faveur du groupe TTH, l'un des trois candidats à la reprise de la société Safra Sa, basée à Albi (Tarn). Fleuron du bus à hydrogène, l'entreprise a été placée en redressement judiciaire le 4 février dernier. Depuis 2018, de nombreux salariés alertaient sur les mauvais choix stratégiques de l'entreprise. C’était le fleuron français dans l’innovation du transport en commun. La Safra à Albi n’aura pas survécu à son bus à hydrogène.
En vain, un maire d'une commune rurale saisit la justice pour empêcher la fermeture d'une classe
Le 1er avril, la commune de Laroque-d'Olmes (Ariège) a déposé un référé auprès du tribunal administratif de Toulouse pour demander l'annulation d'une décision prise par le directeur académique des services de l'éducation nationale de l’Ariège. Il retirait un poste d'enseignant à l'école primaire de la commune et actait ainsi la fermeture d'une classe. Le maire de cette petite commune ariégeoise de 2400 habitants se bat pour ne pas voir une classe supprimée à la rentrée 2025.
Mort du pape. "J’aime bien dire que le pape François nous dérangeait", l’archevêque se souvient d’un pontife qui a bousculé l’Église
Le 9 décembre 2021, le pape François nommait Monseigneur Guy de Kérimel, archevêque de Toulouse. Il réagit à la disparition du souverain pontife. Une messe sera célébrée en hommage au pape le mercredi 23 avril 2025 à la cathédrale Saint-Etienne de Toulouse à 19h. Monseigneur Guy de Kérimel est devenu archevêque de Toulouse suite à sa nomination par le pape François le 9 décembre 2021. L'ancien évêque de Grenoble et de Vienne réagit à la disparition du souverain pontife.
Un entrepôt détruit par un incendie, 70 personnes au chômage
L'entreprise Royal Saveurs basée à Marignac (Tarn-et-Garonne) a été victime d'un incendie dans la nuit du lundi 21 avril au 22 avril 2025. D'importants moyens ont été déployés sur place. 70 personnes se retrouvent au chômage. Peu avant 23h dans la nuit du lundi 21 avril au 22 avril 2025, le SDIS du Tarn-et-Garonne a dû intervenir pour l'incendie d’un entrepôt situé au 61 route de Pessoulens sur la commune de Marignac. La toiture métallique de 3 500 m2 était totalement embrasée.
Santé des élèves, nouvelle université, ND de Garaison : la nouvelle rectrice d'Académie fait sa rentrée
Carole Drucker-Godard, récemment nommée Rectrice de la région académique Occitanie et Rectrice de l’académie de Montpellier faisait un point presse. La nouvelle équipe, les priorités, une nouvelle université à Tarbes ou encore comment renforcer les contrôles sur l'enseignement privé pour éviter de nouveaux Bétharram ou Notre Dame de Garaison, on fait le point. Les 3 personnes se connaissent et veulent travailler ensemble.
Affaire Notre-Dame de Garaison : deux nouvelles plaintes pour des faits de violences peut-être non prescrits
À l’instar de Notre-Dame de Bétharram dans le département voisin, la parole se libère dans un autre établissement privé catholique : Notre-Dame de Garaison (Hautes-Pyrénées). Deux nouvelles dépositions ont été faites auprès du parquet de Tarbes pour des violences aggravées subies par un ancien élève en 2017.
Une mission de sauvetage tourne au drame dans les Pyrénées : un secouriste et un alpiniste trouvent la mort lors d’une chute fatale
Lundi 7 avril 2025, un alpiniste et un secouriste, qui tentait de l'aider, ont fait une chute mortelle dans les Hautes-Pyrénées sur la commune d'Aragnouet. Un nouveau drame qui vient endeuiller une fois de plus le milieu de la montagne. Un alpiniste et un secouriste venu pour l'aider ont fait une chute mortelle le lundi 7 avril dans les Hautes-Pyrénées. Le drame s'est déroulé sur la commune d'Aragnouet dans la zone du pic de Campbieil.
"Si c’est mettre de l'argent pour la défense européenne, on n’est pas d’accord" : les communistes ne veulent pas payer un tribut de guerre
"L’Occitanie sera un acteur clé du réarmement et de la souveraineté européenne, et la Région y contribuera !" Après l'annonce de Carole Delga de prévoir un plan de 200 Millions d'euros pour soutenir les entreprises de défense, les élus communistes de la région ne sont pas d'accord. La France comme l'Europe ne parlent plus que de réarmement pour faire face au nouveau contexte international.
"Le RN remet en cause l'état de droit" : polémique après une conférence de presse du parti de Marine Le Pen au Club de la presse
Vendredi 4 avril 2025, la Fédération Rassemblement National de l'Hérault organisait "une conférence de presse pour présenter les enjeux après la condamnation de Marine le Pen." Elle se tenait dans les locaux du Club de la presse d'Occitanie de Montpellier. Des journalistes protestent dans une lettre ouverte.
The need to implement FAIR principles in biomolecular simulations - Nature Methods
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In the Big Data era, a change of paradigm in the use of molecular dynamics is required. Trajectories should be stored under FAIR (findable, accessible, interoperable and reusable) requirements to favor its reuse by the community under an open science paradigm.
By Rommie Amaro, Ivet Bahar, Massimiliano Bonomi, Gregory Bowman, Giovanni Bussi, Christophe Chipot, G. Andrés Cisneros, Peter Coveney, Roberto Covino, Matteo Dal Peraro, Lucie Delemotte, Jonathan W. Essex, Franca Fraternali, Francesco L. Gervasio, Fernando González-Nilo, Helmut Grubmüller, Marina G. Guenza, Horacio V. Guzman, Teresa Head-Gordon, Niu Huang, Xuhui Huang, Gerhard Hummer, Wanting Jiao, Syma Khalid, Charles A. Laughton, Kresten Lindorff-Larsen, Sharon M. Loverde, Magnus Lundborg, Yun Luo, F. Javier Luque, Charlotte Lynch, Siewert J. Marrink, J. Andrew McCammon, Kenneth M. Merz, Adrian J. Mulholland, Athi N. Naganathan, Frank Noe, Agnes Noy, Megan L. O’Mara, Mary Jo Ondrechen, José N. Onuchic, Alberto Perez, Alberto Pérez, Juan Perilla, Jean-Philip Piquemal, Adolfo B. Poma, Matej Praprotnik, Nathalie Reuter, Carme Rovira, Benoît Roux, Ursula Rothlisberger, Karissa Y. Sanbonmatsu, Carlos Simmerling, Jeremy Smith, Yuji Sugita, Katarzyna Świderek, Peng Tao, D. Peter Tieleman, Irina G. Tikhonova, Julian Tirado-Rives, Sameer Velankar, Stacey D. Wetmore, Lee-Wei Yang, Martin Zacharias, Josep Ll. Gelpí, Ariel Warshel
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Baisser son salaire ou augmenter ses tarifs : le dilemme des autoentrepreneurs face à la diminution du seuil de la TVA
Les autoentrepreneurs et les professions indépendantes manifestent aujourd'hui dans plusieurs villes dont Toulouse pour protester contre l'abaissement du seuil d'exonération de la TVA à 25 000€. Une charge supplémentaire qu'il faudra bien répercuter sur les clients ou ponctionner sur leur salaire. Une femme de ménage nous explique les conséquences. Jusqu'à présent, les autoentrepreneurs ne payaient pas de TVA lorsque leur chiffre d’affaires était inférieur à 37 500 €.
IMAGES. "C'est contre-intuitif mais écologique" : la spirale bleue aperçue dans le ciel de France, un spécialiste explique ce phénomène
Les curieux et les passionnés ont pu voir ce phénomène lumineux dans le ciel ce lundi 24 mars vers 21 heures. Une étonnante spirale bleue largement observée et publiée sur les réseaux. Mais connaît-on vraiment les raisons de cette apparition et ses conséquences sur l'environnement ? Olivier Sanguy, responsable de l’actualité spatiale à la cité de l’espace de Toulouse nous éclaire.
Un jeune de 25 ans trouve la mort dans un accident de voiture
Les pompiers de l'Aveyron sont intervenus mercredi 12 mars 2025 pour un accident de la circulation peu avant 1h du matin. Un véhicule avec deux occupants a percuté un obstacle. Le passager âgé de 25 est décédé malgré les secours arrivés rapidement sur place. Il était minuit cinquante-trois, mercredi 12 mars, lorsque le SDIS de l'Aveyron a dû intervenir pour un accident de la route, sur la RD 911, juste avant de rentrer dans Millau. 11 sapeurs pompiers se sont rendus sur place.
Deux sans-abri condamnés après l'incendie d'un bar de nuit
Le 28 janvier dernier, un établissement de nuit situé à Albi (Tarn) a été ravagé par un incendie. Deux sans-abri présents au moment des faits avaient été interpellés. Placés en détention provisoire, les deux prévenus âgés de 37 et 41 ans ont été jugés le 11 mars à Albi et condamnés pour vol aggravé. Le Notorious Social Club, établissement de nuit albigeois dans le département du Tarn, était fermé depuis décembre 2024 par arrêté préfectoral.
"L'enseignement supérieur et recherche, c’est une force pas un coût", mobilisation nationale contre les coupes budgétaires
Des nouvelles mobilisations sont annoncées dès aujourd'hui mardi 11 mars dans l’enseignement supérieur et la recherche (ESR). Les enseignement mais aussi le personnel administratif et les étudiants protestent contre les coupes budgétaires qui mettent en péril ce service public. Fait rarissime : c'est une intersyndicale forte d'une quinzaine d'organisations qui appellent à ces mouvements.
"Les charges augmentent mais pansements et injections coûtent toujours le même prix, les déplacements aussi." La refonte du métier d'infirmier à l'Assemblée Nationale
Une proposition de loi est en cours d'examen à l’Assemblée nationale pour la revalorisation du métier d'infirmier. Les tarifs des soins n'ont pas évolué depuis 2009. Une injection c'est 4€50, un déplacement 2€50... Autant dire que les débats à la chambre des députés sont très attendus et suivis par cette profession. Nous avons suivi un infirmier qui travaille depuis 12 ans dans un cabinet libéral toulousain.
Fortes perturbations du trafic SNCF au départ et à l'arrivée de Toulouse
Ce lundi matin, un "train-travaux" qui permettait de faire des rénovations de voies à la gare Matabiau de Toulouse n'a pas pu être déplacé avant le retour du trafic. Conséquences : de nombreuses perturbations et suppressions de trains en direction de l'Ariège et du Comminges vers Tarbes. Le trafic a repris peu avant 9h. Cette nuit, des travaux ont eu lieu à la gare Matabiau de Toulouse afin de rénover certaines voies comme c'était le cas ces derniers jours.
Boycotter les Etats-Unis en matière d'armement, la recommandation aux Européens d'un dirigeant d’Airbus en matière de défense
Le patron de la branche militaire d'Airbus vient de mettre en garde le futur gouvernement allemand contre des commandes auprès d’industriels américains pour réarmer l'Allemagne. "Si on utilise la hausse des dépenses de défense pour continuer à acheter des produits standards aux États-Unis, nous renforçons notre dépendance vis-à-vis des autres pays", a déclaré Michael Schöllhorn.
Boycotter les Etats-Unis en matière d'armement, la recommandation aux Européens d'un dirigeant d’Airbus en matière de défense
8 hours ago L'explosion en vol de la fusée Starship de SpaceX jeudi 6 mars a provoqué des perturbations dans le trafic aérien. Une enquête va être ouverte par l'agence américaine de l'aviation, mais plane le doute de conflit d'intérêts avec Elon Musk, patron de la société spatiale. Sur les panneaux d'affichage …
"Nous n'avons ni véhicule, ni permis" : le précarité de 13 femmes de ménage laissées-pour-compte après le déménagement de l'administration
À l'occasion du déménagement de la cité administrative de Toulouse, plusieurs femmes de ménage ne travailleront plus sur le nouveau site. Elles sont 13, parfois avec plus de 30 ans d'ancienneté, plus ou moins proches de la retraite à être dans l'attente. Reclassées, leur histoire révèle toute la problématique d'un secteur en difficulté et où la précarité pèse sur leurs vies.
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